生物标准物质广泛应用于生物医药、临床化学、检验检疫、食品安全等领域，在量值传递、量值溯源、实验室检验标准制定和质量控制中起着重要作用，但生物标准物质研制过程中面临的一些困难限制了生物标准物质的发展。

一、溯源性我国目前已批准生物标准物质的特性值主要以质量分数、摩尔浓度、质量浓度形式给出，在生物测量中尚有很多生化测量量值溯源体系有待建立和完善。

二、原材料研制标准物质的基础是原材料，而生物标准物质原材料来源和质量都不稳定。如临床医学检验用血液、尿液等原材料，其成分复杂，个体差异性较大，且难以保证稳定的来源；核酸标准物质易被核酸酶降解，尤其是RNA成分极易被环境中的RNA酶降解，难以保证RNA的完整性；酶活性标准物质易受物理、化学因素影响而降低活性。核酸、蛋白类标准物质缺少统一的提取标准，不同厂家试剂盒提取、纯化效率、纯度和质量有较大差异，据有关研究表明，不同DNA提取方法，其得率差异高达40倍。提取纯化得到的DNA，其浓度和质量的测量方法直接影响最终定量结果。原材料种类繁多，其选择、处理和检测方法的评价优化是一项长期而繁琐的工作，制定相关标准，减小差异性，是开展标准物质研制工作的前提和基础。

三、定值方法生物标准物质定值方法比较复杂，往往需要昂贵的仪器设备及实验耗材，如用于核酸精确测量的电感耦合等离子体发射光谱仪、实时荧光定量PCR、数字PCR等。其中，数字PCR可以实现核酸的绝对定量，具有无需任何校准物的绝对定量能力，但因价格昂贵限制了该技术的广泛使用。目前，实时荧光定量PCR技术得到了广泛应用，但在已发表的文献中，实验者往往直接引用其他作者的实验方法，缺少实验方法的适用性评价及实验条件的优化。实时荧光定量PCR实验中，核酸质量、引物评价及优化、扩增程序优化、扩增效率评价等直接影响了测量结果的准确性。MIQE（MinimumInformationforPublicationofQuantitativeReal-TimePCRExperiments）提出了进行实时荧光定量PCR实验所必须提供信息的最低限度。该项标准的制定，使得科学工作者可以获得一致、高质量的qPCR实验数据，同时可以规范实验操作，提高研究者对实验结果的可信度。因此，生物标准物质研制过程中，制定严格的检测、评价标准至关重要。另外，定值过程中的操作水平对检测结果的影响也很大，例如在核酸样品制备中，琼脂糖凝胶电泳、产物纯化、回收等操作直接影响样品质量和浓度。生物标准物质的研制工作需要操作过硬、经验丰富的技术人员来完成。

四、形态及形式生物标准物质可以制备成不同形态，如基因组DNA或质粒DNA，也可以制备成不同形式，如冻干或冷冻样品。制备方式的不同，可能会导致相同特性在标准物质与真实样品中产生差异。在选定标准物质时，应根据该标准物质预期用途，尽可能接近日常测量样品的形态和形式，或进行互换性评估。